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      转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。随着新一代高通量测序技术运用到转录组研究之中,正在改变着人们对转录组的认识……

Nature:史上最大型RNA测序研究成果
来自日内瓦大学医学院的研究人员领导一个欧洲科学家小组,发布了一张人类功能性遗传变异的综合图谱。这一研究发表在9月15日的Nature和Nature Biotechnology杂志上,提供了有史以来RNA水平上最大的人类基因组与基因活性关联数据集。




      RNA测序新成果  


北京大学Nature子刊单细胞RNA测序新成果
来自北京大学第三医院、教育部辅助生殖重点实验室的研究人员,采用先进的单细胞RNA测序技术绘制出了人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组全景图,这一重要的研究成果发表在《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。

中外科学家Nature发表单细胞测序新成果
来自同济大学医学院、南京医科大学和加州大学洛杉矶分校的科学家们,利用强大的单细胞RNA测序技术以前所未有的精确水平,追踪了人类和小鼠胚胎的遗传发育。该技术使得研究人员能够更早及更准确地诊断遗传病,即便是在8细胞期。

Nature子刊:RNA测序详解病原菌生活史
世界上许多农作物都受到一类包括680多种菌种的真菌感染。在这种真菌的感染初期,病原菌在植物细胞中悄无声息地生长,而后会转变为更具破坏性的生活方式,并以死细胞为食。其中有些菌种完全转变为破坏性生长方式,其余菌种则能够同时保持两种生活模式。马克斯普朗克植物育种研究所的科学家团队发现了两种真菌生活模式背后的遗传学基础。

中科院最新文章:转录组测序解析癌症mRNA
来自中科院计算技术研究所生物信息学研究组,生物物理研究所等处的研究人员通过建立一个综合性的数据分析流程,比较了poly(A)+及 poly(A) mRNA 在正常细胞系和对应的癌症细胞系中的表达差异,指出poly(A) mRNA 也可能在癌症的发生和发展中发挥着重要的作用。




      值得关注的基因组测序研究:


中国科学家Nature Genetics发布重要基因组草图
来自国家人类基因组南方研究中心、新疆医科大学第一附属医院和复旦大学等处的研究人员,成功绘制出了细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus)的基因组序列草图。这一研究提供了关于这种寄生虫与宿主的相互作用、养分吸收、节裂、生殖、免疫逃避和成熟机制的一些新认识,并为我们提供了一个平台推动开发出新的有效包虫病治疗和控制干预措施。

Nature重要成果:公布Hela细胞基因组
来自华盛顿大学的一个研究小组,公布了世界上第一个永生细胞系:Hela细胞的基因组图谱。这一细胞系来自于1951年,一名31岁的非裔美国烟农、5个孩子的母亲Henrietta Lacks,她被侵袭性宫颈癌夺取了生命。他们是在通过与Lacks家族谈论后,建立的美国国立卫生研究院(NIH)Hela基因组数据新政策允许下,发布该成果的一个研究团体。

Nature头条:创造世界纪录的基因组测序
来自哥本哈根大学的研究人员,针对生存于大约70万年前的一匹马的骨骼残余物中的DNA分子进行了测序和分析,生成了完整的基因组序列。这是迄今为止测序的最古老基因组,相比于以往记录的,来自西伯利亚丹尼索瓦(Denisova )洞穴有着8万年历史的原始人类基因组,要古老近10倍。这一基因组还以新的视角阐释了马进化的几个方面。

Nature新文章:绘制癌症的基因组图谱
美国国家癌症研究所和国家人类基因组研究所领导,来自癌症基因组图集研究网络(Cancer Genome Atlas Research Network)的一项新研究,揭示了子宫内膜癌的基因突变。新研究发现有可能对罹患侵袭性子宫内膜癌的妇女的治疗计划,以及子宫内膜癌肿瘤分类产生直接的影响。这项研究发表在5月2日的《自然》(Nature)杂志上。



      测序技术面面观:


两篇Nature文章:5种RNA测序法一决胜负
来自哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人员,近日将5种不同的转录组测序(RNA-seq)法进行了对比,比较结果显示RNase H技术在分析低质RNA样品方面优于其他技术,且价格最为便宜;SMART和NuGEN法适应于分析少量RNA。2篇研究论文在线发表在《自然》(Nature)和《自然方法》(Nature Methods)杂志上。

华大基因最新文章介绍高通量测序技术
第二代测序技术, 又称新一代测序技术, 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(2007 年)技术。与 Sanger测序相比, 3种新一代测序技术共有的突出特征是, 单次运行(run)产出序列数据量大, 故而又被通称为高通量测序技术。

Illumina宣布测序技术大创新
Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。




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